支援全国

在50年代，“两院”还承担着很多内地的重点建设工程和国防工程，如长春第一汽车制造厂、沈阳重型机器厂、长春客车厂、中科院上海分院理化研究所工程、“604”工程等。1953年初，华东院开始动员设计人员赴东北、华东现场设计，大多为国防工业和军事工程，如山东青岛海军基地，浙江、福建军用机场等。

与此同时，华东院等还都抽调了很多技术力量支援内地，其中1954年至1956年，华东院陆续调出大批领导干部和技术人员：支援北京414人，支援西北182人，支援西南120人，支援中南59人，支援其他地区99人。这些人员中有相当一部分担任了北京、西北、西南、中南等建筑设计院的领导。院勘察室也支援各地，留上海人员成立了上海勘察站（现上海勘察院的前身）。

1964年，中共中央发出关于“三线”建设的指示后，“两院”纷纷派遣勘察设计人员，组成工作组，奔赴边区，承担“三线”及上海后方基地建设任务，开展现场设计，完成了一批重要工程。1964年华东院当时同机电设计院一起派出精英骨干前往贵州遵义，建立了“综合两院”。上海院从1965年起，组织专门综合勘察设计队，在安徽、江西一带山区负责上海市包建的“小三线”工程项目。